El programa se imparte en la Facultad de Ciencias en Madrid, el Departamento de Física Teórica de la Universidad Autónoma de Madrid ubicado en el Campus de Cantoblanco, Madrid, España, y el Instituto de Física Teórica UAM/CSIC, también en el Campus de Cantoblanco. Estos centros son responsables y colaboran en investigación y docencia.El programa de doctorado en Física Teórica está diseñado como un programa único, liderado por la Universidad Autónoma de Madrid y el Instituto de Física Teórica IFT UAM/CSIC, acreditado como Centro de Excelencia Severo Ochoa. Se adapta a la normativa del Real Decreto 99/2011, con un enfoque en formación investigadora y tesis doctorales.