El Instituto de Investigación Sanitaria del Hospital Clínico San Carlos de Madrid es una organización dedicada a fomentar la investigación, planificar la actividad científica en línea con las áreas definidas en el plan estratégico, proporcionar apoyo metodológico para la realización de proyectos de investigación y ensayos clínicos, gestionar a las personas y sus conocimientos, asegurar el uso de las infraestructuras dedicadas a investigación, gestionar los recursos económicos obtenidos para el desarrollo de la misma y ser la plataforma de traslación de los resultados de investigación a la práctica clínica diaria.