El programa de doctorado en Economía y Gestión Empresarial de la Universidad de Alcalá reúne tres programas previos, con cerca de 90 doctores, tres líneas de investigación y proyectos competitivos. Colabora con institutos de investigación y el Centro Internacional de Formación Financiera (CIFF), aprovechando el entorno industrial del Corredor del Henares. Busca mejorar las tasas de graduación y reducir el abandono, alcanzando una eficiencia del 60% en la defensa de tesis en 10 años.