El programa de Doctorado en Economía tiene como objetivo formar economistas con una sólida formación para analizar problemas económicos relevantes y realizar investigación de frontera. La calidad del programa está respaldada por el éxito del Departamento de Economía de la Universidad Carlos III de Madrid, que ocupa posiciones destacadas en rankings internacionales. Los egresados han logrado posiciones en instituciones de prestigio como Harvard Business School, Universidad de Oxford, Banco de España y FEDEA, entre otros.