Resumen
Method to know the proportion that of the different castes/encastes or lines included in the racial prototype of the bovine breed of lidia there are in animals or samples of animals of said breed. The present invention refers to an effective method to affirm with high reliability that a specimen is of the lydia race, to know to what caste, encaste or line it belongs, and to know what proportion of its genome has origin in different castes/encastes or lines recognized in the racial bovine prototype of lidia of rd 60/2001 of the ministry of the interior and which are these. The method comprises characterizing certain dna sequences corresponding to markers (microsatellites) in the sample, comparing the genetic formula obtained with a specific and original database, and calculating the probability of assignment of each sample to each reference population, or the proportion of representation in the genome of the sample problem of each caste, encaste or line. (Machine-translation by Google Translate, not legally binding)
Reivindicaciones
1. 1. Método para conocer la proporción que de las diferentes castas/encastes o líneas incluidas en el Prototipo Racial de la Raza Bovina de Lidia hay en animales o muestras de animales de dicha raza, que comprende: 2. a) Analizar una muestra de un animal o de un producto de un animal que contenga material genético, mediante la obtención en las muestras problema de las 24 secuencias de ADN de marcadores del tipo microsatélite definidas por las secuencias de los cebadores (SEQ ID NO: 1 a SEQ ID NO: 48), realizándose la separación de los fragmentos generados por PCR y su clasificación alélica, obteniéndose su genotipo para los 24 marcadores, utilizando como parámetro la longitud de los fragmentos medidos en pares de bases (pb). 3. b) Comparar el genotipo obtenido en a) con los perfiles genéticos poblacionales obtenidos para la población bovina de Lidia global y precisando su pertenencia a las castas, encastes o líneas de referencia (Miura; Pablo-Romero; Casta Navarra; Concha y Sierra; Veragua; Murube- Urquijo; Contreras; Saltillo; Buendía; Graciliano Pérez-Tabernero; Coquilla; Albaserrada; Urcola; Gamero-Cívico; Pedrajas; Conde de la Corte; Atanasio Fernández; Lisardo Sánchez; Juan Pedro Domecq; Marqués de Domecq; Osborne; Núñez; Torrestrella; Hidalgo Barquero; Vega-Villar; Villamarta; Antonio Pérez; Cuadri; Baltasar Ibán; José Marzal; Braganza; Araúz de Robles; María Montalvo; Manuel Arranz; Félix Gómez). 4. c) Asignar a la muestra los coeficientes de pertenencia a cada una de las castas/encastes o líneas genéticas de la raza de Lidia incluidas como poblaciones de referencia en el análisis, en función del parecido genético obtenido de la comparación del paso b) entre la muestra problema y los diferentes perfiles genéticos poblacionales. 5. Secuencias toro de lidia_def.txt SEQUENCE LISTING 6. <110> Universidad Complutense de Madrid; unión de Criadores de Lidia; Asociación de Ganaderías de Lidia 7. <120> Método para conocer la proporción que de las diferentes castas/encastes o líneas incluidas en el 8. Prototipo Racial de la Raza Bovina de Lidia hay en animales o muestras de animales de dicha raza 9. <160> 48 10. <170> BiSSAP 1.0 11. <210> 1 <211> 21 <212> DNA <213> Bos taurus 12. <220> 13. <221> source 14. <222> 1..21 15. <223> /mol_type="DNA" 16. /organism="Bos taurus" 17. <400> 1 18. gagcaaggtg tttttccaat c 21 19. <210> 2 <211> 21 <212> DNA <213> Bos taurus 20. <220> 21. <221> source 22. <222> 1..21 23. <223> /mol_type="DNA" 24. /organism="Bos taurus" 25. <400> 2 26. cattctccaa ctgcttcctt g 21 27. <210> 3 <211> 21 <212> DNA <213> Bos taurus 28. <220> 29. <221> source <222> 1..21 <223> /mol_type="DNA" 30. /organism="Bos taurus" 31. <400> 3 32. gctgccttct accaaatacc c 21 33. <210> 4 <211> 21 <212> DNA <213> Bos taurus 34. <220> 35. <221> source 36. <222> 1..21 37. <223> /mol_type="DNA" 38. Secuencias toro de lidia_def.txt /organism="Bos taurus" # 39. <400> 4 40. cttcctgaga gaagcaacac c 21 41. <210> 5 <211> 25 <212> DNA <213> Bos taurus 42. <220> 43. <221> source 44. <222> 1..25 45. <223> /mol_type="DNA" 46. /organism="Bos taurus" 47. <400> 5 48. taactacagg gtgttagatg aactc 25 49. <210> 6 <211> 24 <212> DNA <213> Bos taurus 50. <220> 51. <221> source 52. <222> 1..24 53. <223> /mol_type="DNA" 54. /organism="Bos taurus" 55. <400> 6 56. gagtagagct acaagataaa cttc 24 57. <210> 7 <211> 20 <212> DNA <213> Bos taurus 58. <220> 59. <221> source 60. <222> 1..20 61. <223> /mol_type="DNA" 62. /organism="Bos taurus" 63. <400> 7 64. gggttcacaa agagctggac 20 65. <210> 8 <211> 20 <212> DNA <213> Bos taurus 66. <220> 67. <221> source 68. <222> 1..20 69. <223> /mol_type="DNA" 70. /organism="Bos taurus" 71. <400> 8 72. gcactattgg gctggtgatt 20 73. <210> 9 <211> 23 74. <212> DNA <213> Bos taurus 75. <220> 76. <221> source 77. <222> 1..23 78. <223> /mol_type="DNA" 79. /organism="Bos taurus" 80. <400> 9 81. gttcaggact ggccctgcta aca 23 82. <210> 10 <211> 23 <212> DNA <213> Bos taurus 83. <220> 84. <221> source 85. <222> 1..23 86. <223> /mol_type="DNA" 87. /organism="Bos taurus" 88. <400> 10 89. cctccagccc actttctctt etc 23 90. <210> 11 <211> 20 <212> DNA <213> Bos taurus 91. <220> 92. <221> source 93. <2 2 2> 1..20 94. <223> /mol_type="DNA" 95. /organism="Bos taurus" 96. <400> 11 97. acctgggaag cctccatatc 20 98. <210> 12 <211> 21 <212> DNA <213> Bos taurus 99. <220> 100. <221> source 101. <222> 1..21 102. <223> /mol_type="DNA" 103. /organism="Bos taurus" 104. <400> 12 105. ctgcaggcag attctttatc g 21 106. <210> 13 <211> 20 <212> DNA <213> Bos taurus 107. <220> 108. <221> source <222> 1..20 <223> /mol_type="DNA" 109. /organism="Bos taurus" 110. <400> 13 111. tgtctgtatt tctgctgtgg 20 112. <210> 14 <211> 20 <212> DNA <213> Bos taurus 113. <220> 114. <221> source 115. <222> 1..20 116. <223> /mol_type="DNA" 117. /organism="Bos taurus" 118. <400> 14 119. acacggaagc gatctaaacg 20 120. <210> 15 <211> 20 <212> DNA <213> Bos taurus 121. <220> 122. <221> source 123. <2 2 2> 1..20 124. <223> /mol_type="DNA" 125. /organism="Bos taurus" 126. <400> 15 127. cccattcagt cttcagaggt 20 128. <210> 16 <211> 20 <212> DNA <213> Bos taurus 129. <220> 130. <221> source 131. <2 2 2> 1..20 132. <223> /mol_type="DNA" 133. /organism="Bos taurus" 134. <400> 16 135. cacatccatg ttctcaccac 20 136. <210> 17 <211> 22 <212> DNA <213> Bos taurus 137. <220> 138. <221> source 139. <222> 1..22 140. <223> /mol_type="DNA" 141. /organism="Bos taurus" 142. <400> 17 143. gatcaccttg ccactatttc ct 22 144. <210> 18 <211> 21 <212> DNA 145. <213> Bos taurus <220> 146. <221> source <222> 1..21 <223> /mol_type="DNA" 147. /organism="Bos taurus" 148. <400> 18 149. acatgacagc cagctgctac t 150. <210> 19 <211> 22 <212> DNA <213> Bos taurus 151. <220> 152. <221> source 153. <222> 1..22 154. <223> /mol_type="DNA" 155. /organism="Bos taurus" 156. <400> 19 157. gatcctgctt atatttaacc ac 158. <210> 20 <211> 22 <212> DNA <213> Bos taurus 159. <220> 160. <221> source 161. <222> 1..22 162. <223> /mo1_type="DNA" 163. /organism="Bos taurus" 164. <400> 20 165. aaaattccat ggagagagaa ac 166. <210> 21 <211> 21 <212> DNA <213> Bos taurus 167. <220> 168. <221> source 169. <222> 1..21 170. <223> /mol_type="DNA" 171. /organism="Bos taurus" 172. <400> 21 173. caaaggtgac actgaggaac c 174. <210> 22 <211> 22 <212> DNA <213> Bos taurus 175. <220> 176. <221> source 177. <222> 1..22 178. <223> /mol_type="DNA" 179. /organism="Bos taurus" 180. <400> 22 181. gaaggaagat tatcaaccct ge 182. <210> 23 <211> 24 <212> DNA <213> Bos taurus 183. <220> 184. <221> source 185. <222> 1..24 186. <223> /mol_type="DNA" 187. /organism="Bos taurus" 188. <400> 23 189. cctttgcaaa tacctcctga ccag 190. <210> 24 <211> 25 <212> DNA <213> Bos taurus 191. <220> 192. <221> source 193. <222> 1..25 194. <223> /mol_type="DNA" 195. /organism="Bos taurus" 196. <400> 24 197. aatggttcta catttgctag gtgtc 198. <210> 25 <211> 24 <212> DNA <213> Bos taurus 199. <220> 200. <221> source 201. <222> 1..24 202. <223> /mo1_type="DNA" 203. /organism="Bos taurus" 204. <400> 25 205. acacaaatcc tttctgccag ctga 206. <210> 26 <211> 24 <212> DNA <213> Bos taurus 207. <220> 208. <221> source 209. <222> 1..24 210. <223> /mol_type="DNA" 211. /organism="Bos taurus" 212. <400> 26 213. aatttaatgc actgaggagc ttgg 214. <210> 27 <211> 20 <212> DNA <213> Bos taurus 215. <220> 216. <221> source 217. <222> 1..20 218. <22B> /mo1_type="DNA" 219. /organism="Bos taurus" 220. <400> 27 221. caacagctat ttaacaagga 222. <210> 28 <211> 20 <212> DNA <213> Bos taurus 223. <220> 224. <221> source 225. <222> 1..20 226. <22B> /tnol_type="DNA¿ 227. /organism="Bos taurus" 228. <400> 28 229. aggctacagt ccatgggatt 230. <210> 29 <211> 22 <212> DNA <213> Bos taurus 231. <220> 232. <221> source 233. <2 2 2> 1..22 234. <223> /mol_type="DNA" 235. /organism="Bos taurus" 236. <400> 29 237. atcctttgca gcctccacat tg 238. <210> 30 <211> 22 <212> DNA <213> Bos taurus 239. <220> 240. <221> source 241. <222> 1..22 242. <223> /mol_type="DNA" 243. /organism="Bos taurus" 244. <400> 30 245. ttgtgcttta tgacactatc cg 246. <210> 31 <211> 24 <212> DNA <213> Bos taurus 247. <220> 248. <221> source 249. <2 2 2> 1..24 250. <223> /mol_type="DNA" 251. /organism="Bos taurus" 252. <400> 31 253. Secuencias toro de lidia_def.txt gctttcagaa atagtttgca ttca 254. <210> 32 <211> 24 <212> DNA <213> Bos taurus 255. <220> 256. <221> source 257. <222> 1..24 258. <223> /mol_type="DNA" 259. /organism="Bos taurus" 260. <400> 32 261. atcttcacat gatattacag caga 24 262. <210> 33 <211> 22 <212> DNA <213> Bos taurus 263. <220> 264. <221> source 265. <222> 1..22 266. <223> /mol_type="DNA" 267. /organism="Bos taurus" 268. <400> 33 269. tgcatggaca gagcagcctg ge 22 270. <210> 34 <211> 22 <212> DNA <213> Bos taurus 271. <220> 272. <221> source <222> 1..22 <223> /mol_type="DNA" 273. /organism="Bos taurus" 274. <400> 34 275. gcaccccaac gaaagctccc ag 22 276. <210> 35 <211> 25 <212> DNA <213> Bos taurus 277. <220> 278. <221> source 279. <222> 1..25 280. <223> /mol_type="DNA" 281. /organism="Bos taurus" 282. <400> 35 283. cgaattccaa atctgttaat ttget 25 284. <210> 36 <211> 24 <212> DNA <213> Bos taurus 285. <220> 286. <221> source 287. <222> 1..24 288. <22B> /mol_type="DNA" 289. /organism="Bos taurus" 290. <400> 36 291. acagacagaa actcaatgaa agca 292. <210> 37 <211> 22 <212> DNA <213> Bos taurus 293. <220> 294. <221> source 295. <222> 1..22 296. <223> /mol_type="DNA" 297. /organism="Bos taurus" 298. <400> 37 299. gaacctgcct ctcctgcatt gg 300. <210> 38 <211> 22 <212> DNA <213> Bos taurus 301. <220> 302. <221> source <222> 1..22 <223> /mo1_type="DNA" 303. /organism="Bos taurus" 304. <400> 38 305. actctgcctg tggccaagta gg 306. <210> 39 <211> 25 <212> DNA <213> Bos taurus 307. <220> 308. <221> source 309. <222> 1..25 310. <223> /mol_type="DNA" 311. /organism="Bos taurus" 312. <400> 39 313. ctaatttaga atgagagagg cttct 314. <210> 40 <211> 25 <212> DNA <213> Bos taurus 315. <220> 316. <221> source 317. <222> 1..25 318. <223> /mol_type="DNA" 319. /organism="Bos taurus" 320. <400> 40 321. ttggtctcta ttctctgaat attcc 322. <210> 41 <211> 20 <212> DNA <213> Bos taurus 323. <220> 324. <221> source 325. <222> 1..20 326. <223> /mol_type="DNA" 327. /organism="Bos taurus" 328. <400> 41 329. gcaggatcac ttgttaggga 20 330. <210> 42 <211> 20 <212> DNA <213> Bos taurus 331. <220> 332. <221> source 333. <2 2 2> 1..20 334. <223> /mo1_type="DNA" 335. /organism="Bos taurus" 336. <400> 42 337. agacgttagt gtacattaac 20 338. <210> 43 <211> 21 <212> DNA <213> Bos taurus 339. <220> 340. <221> source 341. <222> 1..21 342. <223> /mol_type="DNA" 343. /organism="Bos taurus" 344. <400> 43 345. ccctcctcca ggtaaatcag c 21 346. <210> 44 <211> 25 <212> DNA <213> Bos taurus 347. <220> 348. <221> source 349. <222> 1..25 350. <223> /mol_type="DNA" 351. /organism="Bos taurus" 352. <400> 44 353. aatcacatgg caaataagta catac 25 354. <210> 45 <211> 20 <212> DNA <213> Bos taurus 355. <221> source 356. <222> 1..20 357. <223> /mol_type="DNA" 358. /organism="Bos taurus" 359. <400> 45 360. ctctctgcct ttgtccctgt 20 361. <210> 46 <211> 22 <212> DNA <213> Bos taurus 362. <220> 363. <221> source 364. <222> 1..22 365. <223> /mo1_type="DNA" 366. /organism="Bos taurus" 367. <400> 46 368. aatacacttt aggagaaaaa ta 22 369. <210> 47 <211> 18 <212> DNA <213> Bos taurus 370. <220> 371. <221> source 372. <222> 1..18 373. <223> /mol_type="DNA" 374. /organism="Bos taurus" 375. <400> 47 376. gagagtttca ctgtgcag 18 377. <210> 48 <211> 24 <212> DNA <213> Bos taurus 378. <220> 379. <221> source 380. <222> 1..24 381. <223> /mol_type="DNA" 382. /organism="Bos taurus" 383. <400> 48 384. cgtacccaga ktgagtgaag tatc 385. OFICINA ESPAÑOLA DE PATENTES Y MARCAS 386. ESPAÑA 387. N.° solicitud: 388. Fecha de presentación de la solicitud: 22.03.2013 Fecha de prioridad: 389. INFORME SOBRE EL ESTADO DE LA TECNICA 390. © Intel.: C12Q1/68 (2006.01) 391. DOCUMENTOS RELEVANTES 392. Categoría 393. Documentos citados 394. Reivindicaciones 395. afectadas 396. X 397. CAÑÓN, J. et al., `Genetic variation within the Lidia bovine breed¿, ANIMAL GENETICS, 2008, Vol. 39, No. 4, páginas 439-445, ISSN: 0268-9146, Materiales y Métodos, Tabla S1; Resultados y Discusión. 398. MARTÍNEZ, A.M. et al., `Genetic footprints of Iberian cattle in America 500 years after the arrival of Columbus¿, PLOS ONE, 2012, Vol. 7, No.11, página e49066, ISSN: 1932-6203 (electronic), todo el documento. 399. CAÑÓN, J. et al., `Relative breed contributions to neutral genetic diversity of a comprehensive representation of Iberian native cattle.¿, ANIMAL, 2011, Vol. 5, No. 9, páginas 1323-1334, todo el documento. 400. 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Categoría de los documentos citados X: de particular relevancia 406. Y: de particular relevancia combinado con otro/s de la misma categoría A: refleja el estado de la técnica 407. O: referido a divulgación no escrita P: publicado entre la fecha de prioridad y la de presentación de la solicitud 408. E: documento anterior, pero publicado después de la fecha 409. de presentación de la solicitud 410. El presente informe ha sido realizado 411. IS para todas las reivindicaciones 412. L_l para las reivindicaciones n°: 413. Fecha de realización del informe 414. Examinador 415. Página 416. 05.06.2013 417. J. L. Vizan Arroyo 418. 1/4
