The invention relates to in vitro methods for establishing a prognosis concerning the course of a patient diagnosed with colorectal cancer following the administration of a therapy, monitoring the effect of said therapy on the patient or predicting the clinical response of the patient to the therapy. Said methods are based on measuring the expression levels of pre-determined genes or the levels of the proteins encoded by said genes in relation to basal expression levels.
1. 1. Método in vitro para predecir larespuesta clínica de un sujeto diagnosticado de adenocarcinomacolorectal a una terapia que comprende 2. (i) cuantificar los niveles de expresiónde los genes ALDH1A1, MLH1, RELB, TYMS, GPX2, TFF3, BAK1, CDKN1, FOS, STAT3, CKB, HIG2 y PH-4, o 3. (ii) cuantificar los niveles de proteínascodificadas por los genes ALDH1A1, MLH1, RELB, TYMS, GPX2, TFF3, BAK1, CDKN1, FOS, STAT3, CKB, HIG2 y PH-4, ocualquier variante funcionalmente equivalente de dichasproteínas, 4. 2. Método in vitro para predecir larespuesta clínica de un sujeto diagnosticado de adenocarcinomacolorectal a la terapia que comprende 5. (i) cuantificar los niveles de expresiónde los genes BAK1, MLH1, RELB, TYMS, CKB, TFF3, PH-4, ALDH1Al, CDKN1, FOS, STAT3, GPX2 yHIG2, o 6. (ii) cuantificar los niveles de proteínascodificadas por los genes BAK1, MLH1, RELB, TYMS, CKB, TFF3, PH-4, ALDH1A1, CDKN1, FOS, STAT3, GPX2 y HIG2, ocualquier variante funcionalmente equivalente de dichasproteínas, 7. 3. Método según las reivindicaciones 1 y 2, endonde el parámetro que indica la evolución de un sujetodiagnosticado de adenocarcinoma colorectal antes de laadministración de la terapia se selecciona del grupo de respuestatumoral, riesgo de recaída, la supervivencia libre de enfermedady/o la supervivencia global del sujeto. 8. 4. Método in vitro para monitorizar elefecto de la terapia administrada a un sujeto diagnosticado deadenocarcinoma colorectal, que comprende 9. (i) cuantificar los niveles de expresiónde los genes ALDH1A1, MLH1, RELB, TYMS, GPX2, TFF3, BAK1, CDKN1, FOS, STAT3, CKB, HIG2 y PH-4º 10. (ii) cuantificar los niveles de proteínascodificadas por los genes ALDH1A1, MLH1, RELB, TYMS, GPX2, TFF3, BAK1, CDKN1, FOS, STAT3, CKB, HIG2 y PH-4, ocualquier variante funcionalmente equivalente de dichasproteínas, 11. 5. Método in vitro para monitorizar elefecto de la terapia administrada a un sujeto diagnosticado deadenocarcinoma colorectal, que comprende 12. (i) cuantificar los niveles de expresiónde los genes BAK1, MLH1, RELB, TYMS, CKB, TFF3, PH-4, ALDH1A1, CDKN1, FOS, STAT3, GPX2 yHIG2 o 13. (ii) cuantificar los niveles de proteínascodificadas por los genes BAK1, MLH1, RELB, TYMS, CKB, TFF3, PH-4, ALDH1Al, CDKN1, FOS, STAT3, GPX2 y HIG2, ocualquier variante funcionalmente equivalente de dichasproteínas, 14. 6. Método según cualquiera de lasreivindicaciones 1 a 5, en donde la cuantificación de los nivelesde expresión de los genes ALDHIAI, MLH1, RELB, TYMS, GPX2, TFF3, BAK1, CDKN1, FOS, STAT3, CKB, HIG2, PH-4, BAK1, MLH1, RELB, TYMS, CKB, TFF3, PH-4, ALDH1A1, CDKN1, FOS, STAT3, GPX2 y HIG2 comprende la cuantificación del ARNmensajero (ARNm) de dichos genes, o un fragmento de dicho ARNm, elADN complementario (ADNc) de dichos genes, o un fragmento de dichoADNc, o sus mezclas. 15. 7. Método según cualquiera de lasreivindicaciones 1 a 6, en donde la cuantificación de los nivelesde expresión de los genes ALDH1A1, MLH1, RELB, TYMS, GPX2, TFF3, BAK1, CDKN1, FOS, STAT3, CKB, HIG2, PH-4, BAK1, MLH1, RELB, TYMS, CKB, TFF3, PH-4, ALDHIAI, CDKN1, FOS, STAT3, GPX2 y HIG2 se realiza mediante una reacción en cadenade la polimerasa (PCR) cuantitativa multiplex o un array de ADN oARN. 16. 8. Método según cualquiera de lasreivindicaciones 1 a 7, en donde la cuantificación de los nivelesde la proteína codificada por los genes ALDH1A1, MLH1, RELB, TYMS, GPX2, TFF3, BAK1, CDKN1, FOS, STAT3, CKB, HIG2, PH-4, BAK1, MLH1, RELB, TYMS, CKB, TFF3, PH-4, ALDH1A1, CDKN1, FOS, STAT3, GPX2 y HIG2comprende la cuantificación de las proteínas codificadas por dichosgenes. 17. 9. Método según cualquiera de lasreivindicaciones 1 a 8, en donde la cuantificación de los nivelesde proteína codificada por los genes ALDH1A1, MLH1, RELB, TYMS, GPX2, TFF3, BAK1, CDKN1, FOS, STAT3, CKB, HIG2, PH-4, BAK1, MLH1, RELB, TYMS, CKB, TFF3, PH-4, ALDH1A1, CDKN1, FOS, STAT3, GPX2 y HIG2serealiza mediante western blot, ELISA o un array de proteínas. 18. 10. Método según cualquiera de lasreivindicaciones 1 a 9, en donde la terapia es un tratamientocitotóxico y/o citostático. 19. 11. Método según la reivindicación 10, en dondeel tratamiento citotóxico y/o citostático es quimioterapia, radioterapia, agentes antitumorales o combinaciones de losmismos. 20. 12. Método según la reivindicación 11, en dondela quimioterapia comprende un compuesto seleccionado de un agentealquilante que previene la replicación, una fluorpirimidina, uninhibidor de la timidilato sintetasa, un inhibidor de latopoisomerasa y combinaciones de los mismos. 21. 13. Método según la reivindicación 11, en dondelos agentes antitumorales comprenden agentes antiangiogénicos einhibidores de rutas de señalización. 22. 14. Método según la reivindicación 13, en dondeel agente antiangiogénico es Bevacizumab y el agente inhibidor dela ruta de señalización es Cetuximab, Panitumumab o erlotinib. 23. 15. Método según la reivindicación 12, en dondeel agente alquilante que previene la replicación es oxaliplatino, la fluorpirimidina es 5-fluoruracilo, UFT, Utefos oCapecitabina, el inhibidor de la timidilato sintetasa es raltitrexedy el inhibidor de la topoisomerasa I es irinotecan. 24. 16. Método según cualquiera de lasreivindicaciones 1 a 15, en donde la muestra biológica es unamuestra de tejido o un fluido biológico. 25. 17. Método según la reivindicación 16, en dondela muestra de tejido es tumoral. 26. 18. Método según cualquiera de lasreivindicaciones 1 a 17 en donde el cáncer de colorectal esadenocarcinoma colorectal en estadios II ó III ó IV.