Resumen
In vitro method for the prognosis of severe hepatic fibrosis. The present invention relates to an in vitro method for obtaining useful data for the prognosis of severe hepatic fibrosis in chronic hepatitis c characterized by the detection of the genetic polymorphism rs3778216 of the hdac2 gene or anyone who is in linkage disequilibrium with it. It also refers to an in vitro method for the prognosis and/or diagnosis of said pathology characterized by the detection of said polymorphisms and the determination of clinical variables or other polymorphisms. The present invention also relates to the use of the polymorphism rs3778216 of the hdac2 gene or any that is in linkage disequilibrium with it as a prognostic marker of severe hepatic fibrosis and also to the use of a kit comprising probes for its detection. (Machine-translation by Google Translate, not legally binding)
Reivindicaciones
1. REIVINDICACIONES 2. 1. Método in vitro de obtención de datos útiles para el pronóstico y/o diagnóstico de fibrosis hepática grave caracterizado por la detección de al menos un polimorfismo genético del gen HDAC2 seleccionado de la lista que comprende: rs3778216, rs13209064, rs13213007, rs13201727, rs13216873, rs13194921, rs13204434, rs12665655, rs13204445, rs12660414, rs2025191, rs1322453 y rs13212298 en la muestra biológica aislada de un sujeto que padece hepatitis crónica C. 3. 2. Método según la reivindicación 1 que además comprende asociar el genotipo G/G del polimorfismo genético rs3778216, el genotipo A/A del polimorfismo genético rs13212298, el genotipo C/C del polimorfismo genético rs12665655, el genotipo A/A del polimorfismo genético rs13204445, el genotipo T/T el polimorfismo genético rs13204434, el genotipo A/A del polimorfismo genético rs13194921, el genotipo T/T del polimorfismo genético rs13209064, el genotipo C/C del polimorfismo genético rs13213007, el genotipo T/T del polimorfismo genético rs13216873, el genotipo G/G del polimorfismo genético rs12660414, el genotipo T/T del polimorfismo genético rs2025191, el genotipo A/A del polimorfismo genético rs13201727, o el genotipo C/C del polimorfismo genético rs1322453 del gen HDAC2 a un pronóstico y/o diagnóstico de fibrosis hepática grave. 4. 3. Método según cualquiera de las reivindicaciones 1 ó 2 donde el polimorfismo genético del gen HDAC2 es rs3778216. 5. 4. Método según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 3 donde además se detectan los niveles de aspartato aminotransferasa (AST). 6. 5. Método según la reivindicación 4 donde la asociación a un diagnóstico de fibrosis hepática grave se obtiene si los valores de AST son superiores a 40 U/L. 7. 6. Método según cualquiera de las reivindicaciones 2 a 5 donde la asociación a un pronóstico y/o diagnóstico de fibrosis hepática grave se obtiene si la edad del paciente es superior a 40 años. 8. 7. Método según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 6 donde además se detecta al menos un polimorfismo genético del gen STAT1 seleccionado de la lista que comprende: rs2030171, rs13029247, rs10173099, rs10199181, y rs6745710. 9. 8. Método según la reivindicación 7 donde la asociación a un pronóstico y/o diagnóstico de fibrosis hepática grave se obtiene cuando además el sujeto es portador del genotipo G/G del polimorfismo genético rs2030171, del genotipo T/T del polimorfismo genético rs13029247, del genotipo C/C del polimorfismo genético rs10173099, del genotipo T/T del polimorfismo genético rs10199181, o del genotipo C/C del polimorfismo genético rs6745710 del gen STAT1. 10. 9. Método según cualquiera de las reivindicaciones 7 u 8 donde el polimorfismo genético del gen STAT1 es rs2030171. 11. 10. Método según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 9 donde además se detecta al menos un polimorfismo genético del gen ISGF3G o del gen TM9SF1 seleccionado de la lista que comprende: rs12436555, rs12432194 y rs10583 para el pronóstico y/o diagnóstico de la fibrosis. 12. 11. Método según la reivindicación 10 donde la asociación a un pronóstico y/o diagnóstico de fibrosis hepática grave en el paso (b) se obtiene cuando además el sujeto es portador del alelo A del polimorfismo genético rs12436555 o del alelo T del polimorfismo genético rs12432194 del gen ISGF3G, o del alelo A del polimorfismo genético rs10583 del gen TM9SF1. 13. 12. Método según cualquiera de las reivindicaciones 10 u 11 donde el polimorfismo genético del gen ISGF3G es rs12436555. 14. 13. Método según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 12 donde la muestra biológica se selecciona de la lista que comprende tejido, mucosa oral, sangre, plasma, suero y linfa. 15. 14. Método según la reivindicación 13 donde la muestra biológica es sangre. 16. 15. Método según las reivindicaciones 1 a 14 donde la detección del polimorfismo se realiza mediante sondas de hibridación marcadas con fluoróforos. 17. 16. Método según cualquiera de las reivindicaciones 1 a 15 donde el sujeto es un humano. 18. 17. Uso de un kit que comprende las sondas SEQ ID NO:4, SEQ ID NO:5 y SEQ ID NO:6 que detectan el polimorfismo genético rs3778216 del gen HDAC2 para la obtención de datos útiles para el pronóstico y/o diagnóstico de fibrosis hepática grave en un sujeto que padece hepatitis C crónica. 19. 18. Uso de un kit según la reivindicación 17 que además comprende las sondas SEQ ID NO:7, SEQ ID NO:8 y SEQ ID NO:9 que detectan el polimorfismo genético rs2030171 del gen STAT1, y/o las sondas SEQ ID NO:10, SEQ ID NO:11 y SEQ ID NO:12 que detectan el polimorfismo genético rs12436555 del gen ISGF3G. 20. 19. Uso de un kit según cualquiera de las reivindicaciones 17 ó 18 donde el sujeto es un humano. 21. 20 21 22. FIG.1 23. FIG.2 A FIG.2 B 24. FIG.2 C
