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Platform to capture integron cassettes (Machine-translation by Google Translate, not legally binding)CM Patents

Índice de la ficha

Updated at
24/07/2026
Numero publicacion
ES.2969666.A1
Fecha publicacion
21/05/2024
Numero solicitud
ES20230030912
Fecha presentacion
08/11/2023

En detalle

Resumen

Platform to capture integron cassettes. The present invention relates to a platform for capturing integron cassettes from exogenous DNA samples or from donor strains containing them. The platform includes a blind reporter system constructed by inserting an attl integration site into the toxin gene of a toxin/antitoxin system, the corresponding antitoxin gene, and the intl integrase gene. The platform can be built entirely on plasmids or include some parts in the chromosome of a Gram-negative bacteria, especially in E. coli. The invention also includes methods and kits for detecting integron cassettes using the platform. (Machine-translation by Google Translate, not legally binding)

Reivindicaciones

1. REIVINDICACIONES 1. Plataforma para captar casetes de integrones que incluye un sitio de integraciónattlinsertado en el gen que codifica una toxina de un sistema toxina/antitoxina, el gen de la antitoxina de la toxina de dicho sistema toxina/antitoxina y el gen de la integrasaintl,donde el sitio de integraciónattlestá insertado en el gen de la toxina sin modificar la funcionalidad de la proteína. 2. Plataforma para captar casetes de integrones según la reivindicación 1 en la que el sitio de integración esattll. 3. Plataforma para captar casetes de integrones segúncualquiera de las reivindicaciones anteriores en la que el sistema toxina/antitoxina es el sistemaccdB/ccdA. 4.Plataforma para captar casetes de integrones según la reivindicación 3 en la que el genccdBcon el sitio de integraciónattlinsertado se corresponde con la secuencia SEQ ID NO:30. 5. Plataforma para captar casetes de integrones según cualquiera de las reivindicaciones anteriores en la que el gen que codifica la toxina y tiene el sitio de integraciónattlinsertado está incluido en el cromosoma de una bacteria hospedadora. 6. Plataforma para captar casetes de integrones según cualquiera de las reivindicaciones 1-4 en la que el gen que codifica la toxina y tiene el sitio de integraciónattlinsertado está incluido en un plásmido. 7. Plataforma para captar casetes de integrones según la reivindicación 5 en la que el gen que codifica la antitoxina se introduce en el cromosoma de una bacteria hospedadora. 8. Plataforma para captar casetes de integrones según cualquiera de las reivindicaciones 5-6 en la que el gen de la antitoxina se introduce en un plásmido. 9. Plataforma para captar casetes de integrones según cualquiera de las reivindicaciones anteriores en la que el genintlestá incluido en un plásmido. 10. Plataforma para captar casetes de integrones según la reivindicación 9 en la que el plásmido donde está incluido el genintles de alto número de copias. 11. Plataforma para captar casetes de integrones según la reivindicación 6 en la que el gen de la antitoxina y el genintlestán incluidos en un mismo plásmido y el gen de la toxina con el sitio de integraciónattlinsertado está en otro plásmido. 12. Plataforma para captar casetes de integrones según la reivindicación 11 en la que los dos plásmidos son de alto número de copias. 13. Plataforma para captar casetes de integrones según cualquiera de las reivindicaciones anteriores en la que los promotores del gen de la toxina, del gen de la antitoxina y del genintlson promotores inducibles. 14. Plataforma para captar casetes de integrones según la reivindicación 13 en la que los promotores inducibles se seleccionan del grupo formado por: Pi_ac, P<bad>y/o Pvan. 15. Plataforma para captar casetes de integrones según la reivindicación 14 en la que el promotor inducible del gen de la toxina es Pi_ac, el promotor inducible del gen de la antitoxina es P<bad>y el promotor inducible deintles Pvan. 16. Plataforma para captar casetes de integrones según cualquiera de las reivindicaciones anteriores en la que el gen de la integrasa esintll. 17. Bacteria hospedadora de la especieE. colique incluye cualquiera de las plataformas definidas en las reivindicaciones 1-5, 7, 9, 10 13-16 en la que el gen que codifica la toxina y tiene el sitio de integraciónattlinsertado está incluido en el cromosoma de la bacteria hospedadora, el gen que codifica la antitoxina está incluido en el cromosoma de la bacteria hospedadora, y el genintlestá incluido en un plásmido. 18. Bacteria hospedadora de la especieE. colidepositada con la referencia CECT30915. 19. Bacteria hospedadora que incluye cualquiera de las plataformas definidas en las reivindicaciones 1-4, 6, 8-16 en la que el gen que codifica la toxina y tiene el sitio de integraciónattlinsertado está incluido en un plásmido, el gen que codifica la antitoxina está incluido en un plásmido, y el genintlestá incluido en un plásmido. 20. Método de detección de casetes de integrón de una cepa bacteriana bajo estudio que incluye poner en contacto la cepa bajo estudio con la bacteria hospedadora definida en cualquiera de las reivindicaciones 18-19 en condiciones que permitan la conjugación de plásmidos de la cepa bajo estudio, y la recombinación de los casetes de integrón de la cepa bajo estudio en el sitioattlde la bacteria hospedadora. 21. Método de detección de casetes de integrón de una cepa bacteriana bajo estudio que incluye la introducción en la cepa bajo estudio de cualquiera de las plataformas definidas en las reivindicaciones 1-4, 6, 8-16 donde el gen que codifica la toxina y tiene el sitio de integraciónattlinsertado, el gen de la antitoxina y el genintlestán incluidos en plásmidos. 22. Método de detección de casetes de integrón de una cepa bacteriana bajo estudio que incluye poner en contacto la cepa bajo estudio con la bacteria hospedadora definida en la reivindicación 19. 23. Kit para la detección de casetes de integrón en muestras de ADN que incluye cualquiera de las bacterias definidas en las reivindicaciones 17-19. 24. Kit para la detección de casetes de integrón en muestras de ADN que incluye cualquiera de las plataformas definidas en las reivindicaciones 1-4, 6, 8-16.

Etiquetas

Inventores
Escudero Garcia-Calderon Jose AntonioTrigo da Roza Moutinho Filipa
Solicitantes
Universidad Complutense de Madrid
Clasificacion ipc
C12N 1/ 20 A IC12N 1/ 21 A IC12N 15/ 11 A IC12N 15/ 63 A IC12N 15/ 70 A I
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